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中國學者發(fā)現(xiàn)RA新易感基因VOPP1:基于MR分析的機制研究

發(fā)布時間:  2025-08-20 11:15:14

2025年8月2日,《J Inflamm Res》刊登一項中國學者的孟德爾隨機化(MR, Mendelian Randomization)研究,系統(tǒng)評估了表達數(shù)量性狀位點(eQTLs, expression quantitative trait loci)、代謝物與類風濕關節(jié)炎(RA, rheumatoid arthritis)風險的因果關系,篩選出新的易感基因VOPP1(vesicular overexpressed in cancer pro-survival protein 1),并探討了其作用機制。



摘要

方法:研究于2023年1月至2024年6月在南通大學附屬醫(yī)院開展,收集關節(jié)手術患者滑膜組織樣本。VOPP1功能在體外通過RA成纖維樣滑膜細胞(RA-FLSs, fibroblast-like synoviocytes)和體內(nèi)膠原誘導性關節(jié)炎(CIA, collagen-induced arthritis)大鼠模型驗證。VOPP1表達水平采用定量實時PCR和Western Blot檢測,并評估其對細胞增殖、炎性因子表達及p38絲裂原活化蛋白激酶(p38 MAPK, mitogen-activated protein kinase)信號通路激活的影響。

結果:首次證實VOPP1 eQTL可增加RA風險,且可正向調(diào)控代謝物X?23,587水平,進一步加重RA風險。VOPP1在RA滑膜組織及RA-FLSs中顯著高表達,通過激活p38 MAPK信號通路促進RA-FLSs增殖和炎癥反應。CIA模型中,敲低VOPP1可減輕關節(jié)損傷和滑膜炎癥。

結論:VOPP1是新的RA易感基因,可能通過升高X?23,587水平并激活p38 MAPK信號通路促進疾病進展。


結果

1. MR分析發(fā)現(xiàn)VOPP1是RA新易感基因

MR設計分三步:步驟1,將19,942個eQTLs作為暴露因素,RA為結局;步驟2,將1,400種代謝物作為暴露因素,RA為結局;步驟3,以VOPP1 eQTL為暴露因素,74種代謝物為結局。步驟1結果顯示,具有VOPP1 eQTL遺傳風險的個體RA風險升高,異質性和多效性檢驗無異常,敏感性分析支持這一結果。

2. VOPP1在RA滑膜組織和RA-FLSs中高表達

GSE55457數(shù)據(jù)庫分析、qPCR及Western Blot均顯示,RA滑膜組織VOPP1表達顯著高于正常對照(NC),RA-FLSs中VOPP1蛋白水平亦顯著升高。

3. 潛在機制:調(diào)控X?23,587水平

步驟2和3結果表明,VOPP1 eQTL與X?23,587代謝物水平升高顯著相關,且該代謝物水平升高也增加RA風險,提示VOPP1可能通過調(diào)控X?23,587水平促進RA發(fā)生。

4. 激活p38 MAPK促進增殖與炎癥

敲低VOPP1后,RA-FLSs中p-p38水平下降,加入p38 MAPK激動劑Anisomycin后部分恢復。流式細胞術和EdU實驗顯示,VOPP1敲低抑制細胞增殖,Anisomycin可部分逆轉。ELISA檢測發(fā)現(xiàn),VOPP1敲低降低TNF-α和IL-6分泌,激活p38 MAPK可削弱此抑制作用,表明VOPP1依賴p38 MAPK通路促進RA-FLSs增殖與炎癥反應。

5. 體內(nèi)實驗:敲低VOPP1減輕CIA癥狀

CIA模型中,注射VOPP1 siRNA顯著改善關節(jié)炎指數(shù)和足腫脹,病理染色顯示骨破壞、軟骨退變、滑膜增生減輕,TNF-α和IL-6水平下降。


研究方法

1. 孟德爾隨機化研究設計

本研究遵循《流行病學觀察性研究報告加強聲明》(STROBE)清單,并符合MR的三大核心假設。整體MR設計包括三個步驟:步驟1以19,942個基因表達數(shù)量性狀位點(eQTLs)為暴露因素,類風濕關節(jié)炎(RA)為結局;步驟2以1,400種代謝物為暴露因素,RA為結局;步驟3以VOPP1 eQTL為暴露因素,74種代謝物為結局。

2. 工具變量(IVs)篩選

步驟1使用的篩選標準為P值<5×10??,連鎖不平衡(LD)閾值為clumped kb=10,000且r2=0.001。步驟2使用相同的LD閾值,P值<1×10??,且F統(tǒng)計量>10。步驟3使用相同的LD閾值,P值<5×10??,且F統(tǒng)計量>10。

3. MR分析與敏感性分析

本研究采用R軟件TwoSampleMR包進行雙樣本MR分析,主要分析方法為反向方差加權(IVW),并結合MR Egger、加權中位數(shù)、加權眾數(shù)和簡單眾數(shù)等方法,P值<0.05為統(tǒng)計學顯著。穩(wěn)健性通過異質性檢驗、多效性評估和逐一排除(leave-one-out)分析驗證,確保符合MR排他性假設。

4. GEO數(shù)據(jù)庫分析

利用GEO數(shù)據(jù)庫比較RA患者與健康人群滑膜組織中VOPP1的表達。

5. 人滑膜組織

正?;そM織樣本(n=5)來自接受半月板關節(jié)鏡手術的患者;RA滑膜組織樣本(n=5)來自接受全膝關節(jié)置換術的RA患者。所有RA患者術前未接受改善病情抗風濕藥(DMARDs)治療,僅使用非甾體抗炎藥(NSAIDs)控制癥狀。

6. 細胞分離與培養(yǎng)

組織切成小塊,用II型膠原酶在含5% CO?的37℃搖床中消化3小時,離心收集細胞后重懸于含10%胎牛血清(FBS)、100 U/mL青霉素和100 μg/mL鏈霉素的DMEM培養(yǎng)基中,培養(yǎng)于37℃、5% CO?條件下,選取3-6代RA-FLSs用于實驗,并用脂多糖刺激構建體外模型。

7. 蛋白印跡(Western Blot)

總蛋白用含蛋白酶及磷酸酶抑制劑的RIPA裂解液提取,SDS-PAGE分離后轉移至PVDF膜,室溫5%脫脂奶封閉2小時,4℃孵育一抗,洗膜后室溫孵育二抗1小時,化學發(fā)光法顯影,ImageJ分析條帶灰度。

8. 細胞轉染

VOPP1小干擾RNA(siRNA)購自GENE CREATE,序列詳見原文。使用Lipofectamine 3000轉染至6孔板70%融合度的細胞,48 h后收集。

9. 酶聯(lián)免疫吸附試驗(ELISA)

收集RA-FLSs上清及大鼠血清,按試劑盒說明檢測TNF-α及IL-6水平。

10. 細胞周期與增殖檢測

細胞經(jīng)70%乙醇固定過夜后,PBS洗滌,染色30 min,流式細胞儀檢測;EdU檢測按BeyoClick EdU Kit說明進行,Hoechst染核,倒置熒光顯微鏡觀察。

11. 統(tǒng)計分析

MR分析用R 4.2.1及TwoSampleMR包,細胞周期分析用NovoExpress,統(tǒng)計用GraphPad Prism 9.0。數(shù)據(jù)以均值±標準差(SD)表示,Shapiro–Wilk檢驗正態(tài)性,正態(tài)分布用t檢驗,非正態(tài)用Mann–Whitney U檢驗,P<0.05為顯著差異。


小結

遺傳因素在RA的易感性中起著決定性作用。RA是一種累及全身的慢性炎癥性疾病,表現(xiàn)為關節(jié)炎癥、疼痛、腫脹及結構破壞。既往研究證實,eQTLs是挖掘潛在疾病風險基因的重要工具,為揭示RA的遺傳機制和發(fā)現(xiàn)新靶點提供了有效途徑。





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